本文来源微信公众号圣检E讯，原文标题：呼吸道核酸检测标本选择有门道，上呼吸道标本能否“C 位”出道？
呼吸道感染标本类型
呼吸道感染包括上呼吸道感染和下呼吸道感染。上呼吸道标本易于采集，主要包括口咽拭子、鼻咽拭子、鼻咽吸取物，可用于咽炎、喉炎、扁桃体炎、鼻窦炎病原体的检测。下呼吸道标本包括痰液、气管吸取物、支气管肺泡灌洗液等，用于气管支气管炎、肺炎、肺脓肿等病原体的检测，不同标本类型的临床应用见下表。
上呼吸道标本检测下呼吸道感染的研究进展
01口咽拭子检测下呼吸道感染
题目：评估社区获得性肺炎患者中口咽拭子作为替代下呼吸道样本进行PCR检测的诊断效用
IF：6.1
发表时间：2023年9月
文章要点：
本研究使用PCR方法评估了到急诊科就诊的CAP（Community Acquired Pneumonia）患者的口咽拭子（Oropharyngeal swab，OPs）和下呼吸道（Lower respiratory tract，LRT）标本之间微生物检测的一致性。入组103例确诊的CAP患者，分别取OPs和高质量的LRT标本。LRT标本主要通过诱导痰获得（88%）。以下呼吸道标本为参考标准，口咽拭子对CAP最常见的细菌病原体肺炎链球菌和流感嗜血杆菌的阳性符合率（PPA）、阴性符合率（NPA）和总体符合率分别为85%、99%和95%；86%、98%和93%。卡他莫拉菌的PPA较低（74%），而NPA为100%。对于不太可能引起无并发症CAP的细菌（例如金黄色葡萄球菌和肠杆菌目细菌），结果差异较大。总之，与LRT标本相比，OPs标本对最常见的CAP病原体肺炎链球菌和流感嗜血杆菌检测，具有较高的PPAs和NPAs。这提示使用PCR方法对口咽拭子进行检测是急诊科患者快速病原体检测的替代方法，特别是对于难以获得LRT样本的患者。
02鼻咽拭子检测下呼吸道感染
题目：评估鼻咽拭子在呼吸道细菌感染引起的社区获得性肺炎患者中进行PCR检测的诊断效果
IF：3.7
发表时间：2022
文章要点：
本研究入组了118例患者，评估用鼻咽（Nasopharyngeal swab，NPs）拭子检测肺炎链球菌、流感嗜血杆菌和卡他莫拉菌的性能。以下呼吸道感染标本为参考，鼻咽拭子对肺炎链球菌的阳性符合率（PPA）和阴性符合率（NPA）分别为58%和100%，流感嗜血杆菌的PPA和NPA分别为61%和100%，卡他莫拉菌的PPA和NPA分别为57%和99%。以标准诊断方法为参考，鼻咽拭子对肺炎链球菌的PPA和NPA分别为58%和96%，流感嗜血杆菌的PPA和NPA分别为74%和87%，卡他莫拉菌的NPA为92%。结果表明，鼻咽拭子识别下呼吸道感染最常见病因的PPA有限，无法用于停用抗生素，但其出色的NPA表明可利用鼻咽拭子PCR结果快速进行针对性抗菌治疗。
题目：重症肺炎患儿上、下呼吸道病原菌鉴定的一致性
IF：3.4
发表时间：2023
文章要点：
本研究旨在比较儿童严重肺炎患者鼻咽拭子和支气管肺泡灌洗液（BALF）在病原体检出方面的一致性，探讨鼻咽拭子采样能否替代肺泡灌洗液用于儿童 CAP 的病因诊断。研究入组了153名儿童肺炎患者，研究结果发现鼻咽拭子与BALF中的肺炎支原体的一致性最高（Cohen’s kappa = 0.64），其次是流感嗜血杆菌（Cohen’s kappa = 0.47）。铜绿假单胞菌一致性最差，仅在BALF样本中被检出。
03鼻咽吸取物检测下呼吸道感染
题目：鼻咽吸取物与肺部标本在成人获得性肺炎的分子诊断性能比较
IF：4.0
发表时间：2018
文章要点：
本研究纳入103名成人患者，这些患者均患有社区获得性肺炎（CAP）或慢性阻塞性肺病（COPD）急性加重。所有患者均在入院时同时收集了鼻咽抽吸物和下呼吸道样本（包括诱导痰、气管抽吸物或支气管肺泡灌洗液）。使用多重分子检测方法对样本进行检测，该方法可同时定性检测4种细菌和18种呼吸道病毒。鼻咽抽吸物和下呼吸道样本在病毒检测方面的灵敏度相当，分别为82%和88.5%（p= 0.36）。在6例军团菌肺炎感染中，只有1例在鼻咽抽吸物中被检测到（16%），而所有6例均在下呼吸道样本中被检测到，表明肺部样本对军团菌肺炎的诊断效能明显优于鼻咽抽吸物。因此，肺部样本和鼻咽抽吸物在多重PCR检测呼吸道病毒方面的诊断灵敏度相似。然而，对于嗜肺军团菌的检测，肺部样本的诊断效能明显优于鼻咽抽吸物。
总结
在肺炎患者中，上呼吸道标本可辅助或者替代下呼吸道标本进行病原体检测，但需根据患者身体情况、病原体类型与临床场景进行选择。例如在危急重症或者儿童、老年人等难以获得高质量下呼吸道标本的患者中，口咽拭子/鼻吸取物可以作为替代，检测CAP常见的肺炎链球菌、流感嗜血杆菌或呼吸道病毒等，但需排除定植菌的干扰。
撰写 | 许莹硕
校稿 编审 | 刘娟
编辑 | 谭易秋子
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