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鼻咽拭子: 绘制呼吸道微生物组图谱

新冠病毒的出现引发了科学界对鼻咽微生物组的新好奇。研究人员希望了解SARS-CoV-2如何与其他共同定居在咽喉部的微生物相互作用,因此鼻咽拭子成为了研究的中心。


救护车旁的室外亚裔华人女医生带着个人防护设备,准备从病人身上取鼻咽拭子

探索鼻咽微生物组的秘密

鼻咽--鼻子后面的咽喉上部--蕴藏着多种多样的微生物群落,它们可能会影响呼吸系统的健康和疾病。最近对新冠病毒患者鼻咽拭子的研究揭示了这一微生物群落的新特性。

鼻咽拭子测序能揭示微生物组的哪些信息?

新冠病毒患者的鼻咽拭子进行元基因组测序,发现了1300多个微生物类群,揭示了细菌、病毒和真菌的巨大多样性。然而,个体之间共享的分类群很少,这表明核心微生物群有限。在感染SARS-CoV-2期间,微生物群发生了变化,在轻度和无症状患者中发现了更多的分类群。重症患者的多样性最少。

病原体和抗生素耐药基因是否居住在鼻咽部?

对鼻咽拭子的分析表明,在所有患者群体中都携带有肺炎链球菌等已知的呼吸道病原体,而不仅仅是感染了SARS-CoV-2的患者。抗生素耐药性基因也几乎无处不在,特别是那些编码β-内酰胺耐药性的基因。与未感染的对照组相比,轻度/无症状的新冠病毒患者携带的病原体和耐药基因更高。

SARS-CoV-2感染如何影响鼻咽部微生物组?

SARS-CoV-2感染似乎会导致鼻咽部微生物群失调,使病原体定植增加,抗生素耐药性扩大。这些微生物是否会导致新冠病毒的严重程度仍是未知数。但监测它们的存在可以指导治疗中抗生素的合理使用。

因此......对新冠病毒患者的鼻咽拭子进行测序,让我们对这个研究甚少的人体生态位有了迷人的一瞥。目前仍需继续开展研究,以揭示这种微生物群、新冠病毒等呼吸道感染和患者健康结果之间的联系。

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